目前棕色药瓶包装面临的争论都集中在使用后的处理上。所有人都知道玻璃瓶的原则，减少、再利用、再循环。但对于棕色药瓶包装，回收远远大于重复利用。回收的棕色药瓶所耗用的玻璃能源比利用玻璃原料加工新棕色药瓶要小的多。有很多的棕色药瓶被回收并重新用于在加工中，能帮助节省2-3%的能源消耗。棕色药瓶回收还有利于节省资源，减少污染。
还有一个问题_是棕色药瓶的瓶型跟不上时代，导致了玻璃药瓶的回收利用。虽然很多企业都知道回收能节省很多资金，如果曾经流行的玻璃瓶瓶型已经不在流行了，它_注定要被淘汰了。 然而，棕色药瓶的重复使用能为节省成本带来很大贡献。只要对棕色药瓶进行消毒_能重新进入包装环节，不需要粉粹、熔解和再加工成型。